AMAZING RESUME
188****9400niu****@***.com北京32男系统生物学研究员在职北京25k-35k •系统学习了基因组学、蛋白质组学与网络生物学等核心课程，并通过课程项目独立完成蛋白结构预测与分子对接模拟，掌握多个公共组学数据库的使用；同时参与iGEM合成生物学竞赛，负责代谢通路的建模与数据分析。
•加入神经退行性疾病分子机制课题组，承担RNA-seq和ATAC-seq的数据质控、比对及差异分析，自主搭建了包含基因共表达网络的完整分析流程，在学术组会中培养了批判性思维和科研沟通能力。
•参与撰写一篇关于网络药理学的研究综述，负责从TCGA和DrugBank等数据库挖掘药物-靶点-疾病关联信息，利用Cytoscape构建可视化网络图，系统提升了文献检索、科学绘图和学术写作水平。
北京百奥赛元生物科技有限公司 - 研发部生物医药科技创新
2016.07-2021.06
•主导系统生物学课题的研究推进，涵盖研究方案设计、样本采集规划、多组学数据产出与结果解读，并负责研究报告与科学论文的撰写。
•利用R/Python等工具搭建高通量测序分析流程，对转录组、表观组等数据进行深度挖掘，识别关键调控模块与潜在生物标志物，支持精准诊疗策略的开发。
•与生物学、临床医学、计算机科学等不同背景的成员紧密协作，共同设计并实施转化研究项目，促进系统生物学成果从实验室向临床场景延伸。
•积极参加国内外高水平学术会议，报告研究进展并开展学术交流，与多个研究组建立稳定合作关系，有力提升团队在领域内的可见度。
北京康泰生物科技有限公司 - 研发部生物科技创新研发
2013.07-2016.06
系统生物学助理研究员系统生物学研究辅助实验技术
北京
•配合团队完成系统生物学相关实验及计算任务，负责原始数据的整理、质控与初步统计，并整理实验记录与文献总结。
•掌握并使用R、Python、Cytoscape等工具开展基因表达谱分析、共表达网络构建与可视化展示，支持核心研究结论。
•承担实验室部分运行保障工作，如设备定期校验、试剂耗材库存管理及数据备份归档，保障研究流程高效稳定。
•旁听学术报告并参与技能培训，不断拓展组学分析、编程及数据管理能力，为独立科研打下基础。
多组学整合解析肿瘤细胞代谢重编程 - 多组学数据分析与建模
2018.01-2020.12
•系统收集肿瘤与正常细胞的多组学数据，包括转录组、蛋白质组与代谢组，构建统一的数据处理与质控流程。
•采用XCMS、MetaboAnalyst等工具进行代谢物鉴定与差异分析，结合通路富集识别代谢重编程的关键节点与核心酶。
•利用WGCNA和动态网络模型整合多组学信息，搭建肿瘤代谢调控网络，并通过siRNA敲低实验初步验证网络中的潜在调控因子。
•研究结果在领域内学术会议上展示，并整理成论文投稿至国际期刊。
基于系统生物学的药物重定位与靶点发现平台 - 靶点筛选与算法设计
2014.01-2015.12
•整合疾病相关基因表达谱、蛋白质互作网络和药物分子结构数据库，设计用于药物靶点识别与重定位的计算框架。
•基于图神经网络和随机森林等方法构建候选靶点预测模型，对疾病模块进行打分排序，并筛选出高潜力靶蛋白。
•与药物化学团队协作，对预测靶点进行分子对接与结合自由能计算，辅助先导化合物的优化与选择。
•搭建了包含数据管理、模型训练和结果可视化的自动化流程，提升了药物发现早期阶段的效率，相关算法已申请软件著作权。
对系统生物学在临床与药物研发中的转化充满热情，享受从海量组学数据中挖掘规律并回答生物学问题；严谨细致，能静心打磨每个分析步骤，同时善于与不同背景研究者协作。具有肿瘤代谢重编程与药物研发平台相关经验，以论文和专利形式沉淀了多项成果；期待将系统方法用于更迫切的医学问题。
R语言与统计建模:
熟练基于R开展转录组及基因芯片数据挖掘，曾主导一项WGCNA共表达网络分析并识别核心驱动基因；使用clusterProfiler、GSEA等工具完成功能富集，形成R Markdown可复现分析报告用于组内共享。
Python与生物信息工具:
独立编写过Python脚本从NCBI/Ensembl批量获取基因注释与序列信息，结合Biopython构建本地化BLAST流程；在体外诊断课题中运用pandas和scikit-learn筛选血液样本中的诊断标志物，并用Matplotlib绘制ROC曲线与特征重要性图。
